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The objective is to provide a functional database (OMERO) to all life science laboratories in the Côte d’Azur and to the 3 marine stations of EMBRC-France to facilitate the management, sharing and analysis of biological images and to promote and stimulate the quantitative analysis of data.
This project is carried out by 5 engineers and managers of the digital bio-imaging services of the Université Côte d’Azur, the EMBRC-FR and the IFB : Sophie ABELANET, Faisal BEKKOUCHE, Sameh BEN AICHA, Christophe BLANCHET et Frédéric BRAU.
This team received a CNRS Collective cristal for the project in direct support of research.
The CNRS Collective cristal medal rewards teams of men and women in support functions who have carried out projects with remarkable technical expertise, collective dimension, applications, innovation and outreach. This award is handed out in two categories: « direct support for research » and « research backup ».
The access link : https://bioimage.france-bioinformatique.fr/omero-mica/webclient/login/
Omero Insight, an Omero application to install on your computer. With Omero Insight you will find all the features of Omero including the import of images.
Please select this address: bioimage.france-bioinformatique.fr to use OMERO Insight.
The compatible version to download is 5.5.17
Thanks to Sophie ABELANET (IPMC-CNRS) for the creation of the OMERO Tips and Tricks gifs made every month !
Laboratoire de Biologie du développement UMR 7009
Cette UE se déroule sur 2 semaines et a lieu au laboratoire de Biologie du Développement de Villefranche -sur-Mer (LBDV). Elle inclut l’examen de l’UE d’analyse scientifique (5V089) suivie par les étudiants de la spécialité de Biologie du Développement.
Durant la 1ère semaine, les étudiants participent à des ateliers et des rencontres avec les chercheurs du laboratoire.
Durant la 2ème semaine, les étudiants sont répartis dans les équipes pour y réaliser un mini projet qu’ils présentent le dernier jour du cours. Le cours est donné en anglais pour tout ou partie.
Modalités d’évaluation
Présentation orale du mini-projet (binôme, 100 %)
UE en anglais (partiellement ou totalement)
Master BMC, S3, 6 ECTS
Code UE: 5V200
Responsable de l’UE: Carine BARREAU (MCU): carine.barreau [at] obs-vlfr.fr
Cette UE permet aux étudiants de 1ère année de Master de passer 2 semaines à l’Observatoire Océanologique de Villefranche-sur-Mer. Le cours est obligatoire pour les étudiants du Master Biologie Intégrative, parcours Biologie et Bioressources Marines (BBMA) tandis qu’il peut être choisi en option par les étudiants du Master Biologie Moléculaire et Cellulaire (BMC). Les étudiants participent à des ateliers de présentation des organismes marins utilisés par les équipes de recherche du laboratoire (LBDV) et apprennent à les manipuler au cours de travaux pratiques dont les thématiques vont de la Biologie du Développement fondamentale à la toxicologie appliquée.
Modalités d’évaluation
Analyse d’article et présentation orale (50%)
Compte-rendu écrit de TP (50%)
UE partiellement en anglais
Master BIP, S2, 6 ECTS
Code UE: 4B022 (ouverte au Master BMC)
Responsable de l’UE: Carine BARREAU (MCU): carine.barreau [at] obs-vlfr.fr
Cette UE complémentaire se déroule sur 2 semaines et permet aux étudiants de découvrir les différents aspects (métiers & recherche) de l’Observatoire Océanologique de Villefranche-sur-Mer (OOV). Ateliers et journal clubs sont organisés afin que les étudiants mettent en pratique leurs connaissances théoriques en biologie et développent leur capacité de communication scientifique en français et en anglais.
