Patterning of the ascidian neural tube

 Publications from this project:

  • Hudson C, Yasuo H. (2021). Neuromesodermal Lineage Contribution to CNS Development in Invertebrate and Vertebrate Chordates. Genes doi: 10.3390/genes12040592. hal-03215448v1.
  • Hudson C, Esposito R, Palladino A, Staiano L, Ferrier D, Faure E, Lemaire P, Yasuo H and Spagnuolo A. (2019). Transcriptional regulation of the Ciona Gsx gene in the neural plate. Dev Biol. doi: 10.1016/j.ydbio.2018.12.013. hal-02115329v1.
  • Hudson C (2019). A simple method to identify ascidian brain lineage cells at neural plate stages following in situ hybridisation. Methods in brain development. 2nd Methods in Molecular Biology series, Springer Nature. Methods Mol Biol., 2047:325-345. doi: 10.1007/978-1-4939-9732-9_18. hal-02322828v1
  • Esposito R#, Yasuo H#, Sirour C, Palladino A, Spagnuolo A and Hudson C#. (2017). Patterning of brain precursors in ascidian embryos. Development 144:258-264. DOI: 10.1242/dev.142307. hal-01430785v2.
  • Hudson C. (2016). The central nervous system of ascidian larvae. Wiley Interdisciplinary Reviews: Developmental Biology. doi: 10.1002/wdev.239. hal-01336969v1
  • Hudson C, Sirour C and Yasuo H. (2015). Snail mediates medial-lateral patterning of the ascidian neural plate. Biol., 403, 172-179. DOI: 10.1016/j.ydbio.2015.04.026. hal-01155499v1.
  • Haupaix N, Abitua PB, Sirour C, Yasuo H, Levine M and Hudson C. (2014). Ephrin-mediated restriction of ERK1/2 activity delimits the number of pigment cells in the Ciona Dev. Biol. 394:170-80. DOI: 10.1016/j.ydbio.2014.07.010. hal-02115480v1.
  • Nishitsuji K, Horie T, Ichinose A, Sasakura Y, Yasuo H and Kusakabe TG. (2016). Cell lineage and cis-regulation for a unique GABAergic/glycinergic neuron type in the larval nerve cord of the ascidian Ciona intestinalis. Growth Differ. 54:177-86. DOI : 10.1111/j.1440-169X.2011.01319.x. hal-04103275v1.
  • Hudson C, Ba M, Rouvière C and Yasuo H. (2011). Divergent mechanisms specify chordate motoneurons: evidence from ascidians. Development 138: 1643-52. DOI: 10.1242/dev.055426. hal-02115498v1.
  • Hudson C and Yasuo H. (2008). Similarity and diversity in mechanisms of muscle fate induction between ascidian species. Cell. 100:265-77. DOI: 10.1042/BC20070144. hal-02115560v1. Review.
  • Hudson C, Lotito S and Yasuo H. (2007). Sequential and combinatorial inputs from Nodal, Delta2/Notch and FGF/MEK/ERK signalling pathways establish a grid-like organisation of distinct cell identities in the ascidian neural plate. Development 134: 3527-37. DOI: 10.1016/j.ydbio.2006.08.075. hal-02115570v1.
  • Hudson C and Yasuo H. (2005). Patterning across the ascidian neural plate by lateral Nodal signalling sources. Development 132:1199-210. DOI: 10.1242/dev.01688. hal-02115579v1.
  • Hudson C, Darras S, Caillol D, Yasuo H and Lemaire P. (2003). A conserved role for the MEK signalling pathway in neural tissue specification and posteriorisation in the invertebrate chordate, the ascidian Ciona intestinalis. Development 130:147-59. DOI: 10.1242/dev.00200. hal-02115682v1.
Figure 1. Cell lineages of the ascidian larval CNS (from Hudson and Yasuo, 2005). Cell lineages are indicated as follows: the a-line is coloured red (anterior sensory vesicle precursors) or pink (anterior epidermis and pharynx/neurohypothesis precursors); b-line is green and A-line yellow at the 8-cell stage and light yellow (medial cells) or tan (lateral cells) from the 32-cell stage. Bars connecting two blastomeres on the right-hand side of the drawings indicate sister cell relationship.Small circles in the lateral-A-line precursors on the left hand side indicate that these blastomeres give rise to the motoneurones; the final position of the motoneurones in the visceral ganglion is also indicated on the drawing of the larvae. At the neural plate stage, only the neural plate is shown and the dark blue ovals represent the secondary muscle lineage.
Figure 2. A collection of neural plate markers. At the right of the panels is a schematic drawing of the neural plate when it consists of 6 rows of cells (mid-gastrula stage), with each square representing a neural plate cell. Names of each cell are indicated, which should be prefixed with an ‘a9.’ for a-line cells, ‘A9.’ for A-line cells and ‘b9.’ for b-line cells. I-VI indicate the row number with Row I the closest to the blastopore, which is at the most caudal position of the neural plate. The colour scheme used is the same as in the Cell lineages of the ascidian larval CNS figure. The gene expression pattern analysed is indicated above the photo of the embryo. In these in situ hybridizations the nuclei have been labelled to allow easier identification of individual cells. A schematic drawing of the neural plate with the blastomeres expressing each marker coloured in blue is presented below each embryo. Some of these expression patterns are published in Hudson and Yasuo, 2005; Ci-Otx expression pattern is published in Hudson and Lemaire, 2001.

Personnels Enseignants

Photo annuaire
Carine Barreau
Chercheur | SORBONNE UNIVERSITE
carine.barreau[at]imev-mer.fr
+33 (0) 4 93 76 39 73
Bâtiment Jean-Maetz
Photo annuaire
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Chercheur | SU
joao.carvalho[at]imev-mer.fr
+33 (0) 4 93 76 37 89
Station Zoologique

Master Biologie Moléculaire et Cellulaire

Parcours Biologie Cellulaire et du Développement & Cellules Souches

DEVELOPPEMENT DES ORGANISMES MARINS (DOMO)

Cette UE se déroule sur 2 semaines et a lieu au laboratoire de Biologie du Développement de Villefranche -sur-Mer (LBDV). Elle inclut l’examen de l’UE d’analyse scientifique (5V089) suivie par les étudiants de la spécialité de Biologie du Développement.

Durant la 1ère semaine, les étudiants participent à des ateliers et des rencontres avec les chercheurs du laboratoire.

Durant la 2ème semaine, les étudiants sont répartis dans les équipes pour y réaliser un mini projet qu’ils présentent le dernier jour du cours. Le cours est donné en anglais pour tout ou partie.

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Modalités  d’évaluation

Présentation orale du mini-projet (binôme, 100 %)  

UE en anglais (partiellement ou totalement)

Master BMC, S3, 6 ECTS

Code UE: 5V200

Responsable de l’UE: Carine BARREAU (MCU): carine.barreau [at] obs-vlfr.fr

Master Biologie Intégrative & Physiologie

Parcours Biologie et Bioressources Marines (BBMA)

ORGANISMES MARINS & MODELES BIOLOGIQUES

Cette UE permet aux étudiants de 1ère année de Master de passer 2 semaines à l’Observatoire Océanologique de Villefranche-sur-Mer. Le cours est obligatoire pour les étudiants du Master Biologie Intégrative, parcours Biologie et Bioressources Marines (BBMA) tandis qu’il peut être choisi en option par les étudiants du Master Biologie Moléculaire et Cellulaire (BMC). Les étudiants participent à des ateliers de présentation des organismes marins utilisés par les équipes de recherche du laboratoire (LBDV) et apprennent à les manipuler au cours de travaux pratiques dont les thématiques vont de la Biologie du Développement fondamentale à la toxicologie appliquée.

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Modalités  d’évaluation

Analyse d’article et présentation orale (50%)

Compte-rendu écrit de TP (50%)  

UE partiellement en anglais

Master BIP, S2, 6 ECTS

Code UE: 4B022 (ouverte au Master BMC)

Responsable de l’UE: Carine BARREAU (MCU): carine.barreau [at] obs-vlfr.fr

Licence de Sciences de la Vie

Parcours Biologie et Bioressources marines

Biologie Des Organismes Marins Et Diversité Des Recherches

Cette UE complémentaire se déroule sur 2 semaines et permet aux étudiants de découvrir les différents aspects (métiers & recherche) de l’Observatoire Océanologique de Villefranche-sur-Mer (OOV). Ateliers et journal clubs sont organisés afin que les étudiants mettent en pratique leurs connaissances théoriques en biologie et développent leur capacité de communication scientifique en français et en anglais.

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