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Cell Fate Team

The formation of the embryonic midline fates

Embryonic midline fates of the chordate embryo include the notochord, the ventral part of the neural tube and the anterior endoderm.
In ascidians, two rounds of cell divisions of blastomeres called A5.1 and A5.2 of the 16-cell embryo generate precursors of each of these midline structures (Figure 1).

Figure 1. Cell lineage of A5.1 and A5.2 blastomeres, progenitors
of the midline tissues. Embryos are of the vegetal pole view. Black
barconnecting blastomeres reprisents sister cell relationship.
Note that Ciona embryos are bilaterally symmetrical. En: endoderm,
No: notochord, Neu: neural, Mes: mesenchyme.

We have been focusing on the cell fate choice between notochord and neural which takes place when the A6.2/A6.4 blastomeres divide to give rise to A7.3 and A7.7 notochord precursors and A7.4 and A7.8 neural precursors. Following the formation of the precursors of notochord and neural tissue, a distinct set of genes starts to be expressed in each precursor, suggesting that cell-fate specification begins soon after these cell lineages emerge (Figure 2).

Figure 2. Differential gene activation between notochord and neural
lineages. Gene expression was revealed by in situ hybridisation. Zygotic
expression of Ci-Brachyury and Ci-FoxB, both of which encodes a transcription
factor, is initiated in notochord and neural precursors, respectively.

We are analysing the roles of cell-cell interactions and the cell signalling pathways and  transcriptional controls of lineage-specific genes that govern these cell-fate descisions.

Personnels Enseignants

Photo annuaire
Carine Barreau
Chercheur | SORBONNE UNIVERSITE
carine.barreau[at]imev-mer.fr
+33 (0) 4 93 76 39 73
Bâtiment Jean-Maetz

Master Biologie Moléculaire et Cellulaire

Parcours Biologie Cellulaire et du Développement & Cellules Souches

DEVELOPPEMENT DES ORGANISMES MARINS (DOMO)

Cette UE se déroule sur 2 semaines et a lieu au laboratoire de Biologie du Développement de Villefranche -sur-Mer (LBDV). Elle inclut l’examen de l’UE d’analyse scientifique (5V089) suivie par les étudiants de la spécialité de Biologie du Développement.

Durant la 1ère semaine, les étudiants participent à des ateliers et des rencontres avec les chercheurs du laboratoire.

Durant la 2ème semaine, les étudiants sont répartis dans les équipes pour y réaliser un mini projet qu’ils présentent le dernier jour du cours. Le cours est donné en anglais pour tout ou partie.

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Modalités  d’évaluation

Présentation orale du mini-projet (binôme, 100 %)  

UE en anglais (partiellement ou totalement)

Master BMC, S3, 6 ECTS

Code UE: 5V200

Responsable de l’UE: Carine BARREAU (MCU): carine.barreau [at] obs-vlfr.fr

Master Biologie Intégrative & Physiologie

Parcours Biologie et Bioressources Marines (BBMA)

ORGANISMES MARINS & MODELES BIOLOGIQUES

Cette UE permet aux étudiants de 1ère année de Master de passer 2 semaines à l’Observatoire Océanologique de Villefranche-sur-Mer. Le cours est obligatoire pour les étudiants du Master Biologie Intégrative, parcours Biologie et Bioressources Marines (BBMA) tandis qu’il peut être choisi en option par les étudiants du Master Biologie Moléculaire et Cellulaire (BMC). Les étudiants participent à des ateliers de présentation des organismes marins utilisés par les équipes de recherche du laboratoire (LBDV) et apprennent à les manipuler au cours de travaux pratiques dont les thématiques vont de la Biologie du Développement fondamentale à la toxicologie appliquée.

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Modalités  d’évaluation

Analyse d’article et présentation orale (50%)

Compte-rendu écrit de TP (50%)  

UE partiellement en anglais

Master BIP, S2, 6 ECTS

Code UE: 4B022 (ouverte au Master BMC)

Responsable de l’UE: Carine BARREAU (MCU): carine.barreau [at] obs-vlfr.fr

Licence de Sciences de la Vie

Parcours Biologie et Bioressources marines

Biologie Des Organismes Marins Et Diversité Des Recherches

Cette UE complémentaire se déroule sur 2 semaines et permet aux étudiants de découvrir les différents aspects (métiers & recherche) de l’Observatoire Océanologique de Villefranche-sur-Mer (OOV). Ateliers et journal clubs sont organisés afin que les étudiants mettent en pratique leurs connaissances théoriques en biologie et développent leur capacité de communication scientifique en français et en anglais.

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